Le tapis bactérien est formé par un treillis de filaments dont la plupart sont des cyanobactéries, mais aussi des algues et autres microorganismes. Les illustrations ci-dessous sont extraites de Scoffin (1970), Journal of Sedimentary Petrology.

Filaments bactériens piégeant les particules sédimentaires et formant ainsi une couche organo-sédimentaire. Les filaments photosynthétiseurs sont érigés durant le jour constituant un piège efficace et se couchent en absence de lumière (nuit). C'est cette alternance qui est responsable de la fine lamination de certains tapis.

Le tapis bactériens est constitué d'une communauté relativement complexe.

Treillis de filament bactériens Enteromorpha prolifera (gauche) et vue microscopique du filament Lyngbya (droite).